مطالعه برهم کنش های نانو موتورهای عملکردی و پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا به عنوان استراتژی نوین ضد آلزایمر توسط مدل سازی و شبیه سازی رایانه ای

Authors

سعیده جعفری نژاد

saeideh jafarinezhad محمود دهقانی اشکذری

mahmood dehghani ashkezari علی جبالی

ali jebali ph.d. in medical nanotechnology assistant professor, medical biotechnology research center, islamic azad university-ashkezar branch, ashkezar, yazd, iran.استادیار نانوفناوری پزشکی (دکتری تخصصی)، مرکز تحقیقات زیست فناوری پزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد اشکذر، یزد، ایران

abstract

مقدمه: در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت. روش: در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده ncbi به دست آمده و سپس شبیه سازی با استفاده از نرم افزارdesigner ascalaph  انجام شد. 15 پپتید با ساختار های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به مرحله شبیه سازی انتخاب و سپس با استفاده از نرم افزار hyperchem، به مدت 30.000 پیکو ثانیه پپتیدها در مجاورت نانوموتور های بیست الکله، هایپرسینی و رتینولی سنتز شده قرار داده شدند. سرانجام 4 پارامتر؛ انرژی آزاد، انرژی بین مولکولی، پتانسیل و مجذور مربع اختلاف مقادیر، از نرم افزار استخراج و نسبت تغییرات آن ها محاسبه گردید. نتایج: هر نانوموتوری نسبت به پپتیدهای متفاوت دارای عملکردی متفاوت است. نانوموتور هایپرسینی بر پپتید 5، نانوموتور رتینولی بر پپتید 10 و نانوموتور بیست الکل نیز تا حدودی بر روی پپتید 4 بهترین عملکرد را داشتند. اما چون هر نانوموتوری تنها بر روی پپتید موتانتی خاص تأثیرگذار است و آلزایمر ناشی از موتاسیون های مختلف می باشد، نمی توان برای درمان آلزایمر تنها از یک نوع نانوموتور بهره برد. نتیجه ­گیری: می توان نتیجه گرفت که در تحقیقات درمانی آلزایمر با در نظر گرفتن ساختار سه بعدی و پارامتر های دینامیکی، نانوموتور رتینولی بر روی پپتید موتانت ترانس ممبرن بسیار ایده آل بوده و می تواند راهکار درمانی مناسبی باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

مطالعه برهم‌کنش‌های نانو موتورهای عملکردی و پروتئین پیش‌ساز آمیلوئید بتا به عنوان استراتژی نوین ضد آلزایمر توسط مدل‌سازی و شبیه‌سازی رایانه‌ای

مقدمه: در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش‌ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه‌سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت. روش: در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده NCBI به دست آمده و سپس شبیه‌سازی با استفاده از نرم افزارDesigner Ascalaph  انجام شد. 15 پپتید با ساختار‌های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به م...

full text

مطالعه برهم‌کنش‌های نانو موتورهای عملکردی و پروتئین پیش‌ساز آمیلوئید بتا به عنوان استراتژی نوین ضد آلزایمر توسط مدل‌سازی و شبیه‌سازی رایانه‌ای

مقدمه: در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش‌ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه‌سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت. روش: در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده NCBI به دست آمده و سپس شبیه‌سازی با استفاده از نرم افزارDesigner Ascalaph  انجام شد. 15 پپتید با ساختار‌های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به م...

full text

بررسی عددی و شبیه سازی رایانه ای مدل فنر- قطعه

  We present numerical solutions of the equations of motion of the driven spring-block model with stick-slip dynamics. The system consists of an array of N masses which describes the statistical and dynamic properties of dissipative systems. In this study, we are interested in very low and very high velocity regimes. We show that there is a clear shift in the distribution of slip-force when we ...

full text

بررسی عددی و شبیه سازی رایانه ای مدل فنر- قطعه

در این مقاله فرآیند چسبش – لغزش را برای مدل یک سیستم دینامیکی غیر خطی شامل آرایه ای از N اتم مورد بررسی قرار می دهیم . این مدل بیانگر ویژگیهای آماری و دینامیکی سیستمهای اتلافی است. مدل فنر- قطعه ساده ترین مدل سیستمهای پیچیده واقعی مانند زلزله است که نیاز به شبیه سازیهای بسیار پیچیده و سنگین رایانه ای دارند‘ اما مزیت این مدل در این است که با منابع و مراکز محدود رایانه ای نیز می توان با آن کار کر...

full text

مطالعه برهمکنش بین پروتئین آمیلوئید بتا با یون فلزی روی و نقش آن در بیماری آلزایمر

سابقه و هدف: در این مطالعه به اثر اتصال یون فلزی روی بر تغییرات ساختاری و پایداری پروتئین آمیلوئید بتا، موثر در بروز بیماری آلزایمر در سطوح مولکولی پرداختیم. روش بررسی: این بررسی با کمک محاسبات شبیه سازی دینامیکی مولکولی و با استفاده از نرم افزار گرومکس نسخه 4.6.5 و میدان نیروی 03 Amber و مدل حلال آب SPC216 انجام گرفت. یافته‌ها: به کمک انحراف جذر مربع میانگین، صحت انجام شبیه سازی بررسی و ...

full text

مروری بر تاثیر پپتید های آمیلوئید بتا و پروتئین تائو در بیماری آلزایمر

مقدمه بیماری آلزایمر یک اختلال نورودژنراتیو می‌‌باشد که مشکلات شناختی از جمله نقص در یادگیری و حافظه از علائم آن به شمار می‌‌آیند. در واقع ابتلا به این بیماری یکی از مهم‌‌ترین علل فراموشی محسوب می‌‌شود تا جائیکه بیش از نیمی از افراد مبتلا به زوال عقل در دوران پیری به این بیماری دچار هستند. بیماری آلزایمر حاصل دخالت عوامل مختلفی است که عمدتا بدلیل اختلالات بیوشیمیایی در تولید پروتئین‌‌ها، فعالی...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی

جلد ۳، شماره ۲، صفحات ۱۰۰-۱۱۷

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023